ERP Micro December 2019

Genotype GDS EHEC g

INCLUSIVITY

N° Organism

Serotype O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7 O157:H7

Source

Origin

eae

ATCC 35150 a ATCC 43895 ATCC 43890 ATCC 43894

+ h

1 2 3 4 5 6 7 8 9

Clinical isolate

Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Beef

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +

Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate

OPHD b

OPHD OPHD OPHD OPHD

PSU 93.0058 c PSU 88.0222 PSU 93.0054 PSU Deca 3B

beef

10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46

Clinical isolate

beef

Clinical isolate

Es 190 d

Unknown Unknown Unknown Unknown Unknown

Es 191 Es 192 Es 194 Es 195 Es 189 Es 537 Es 538 Es 567 Es 568 Es 579 Es 620 Es 621 Es 684 Es 685 Es 216 Es 219 Es 242 Es 333 Es334 Es 355 Es 545 FDA e

Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef Beef

Unknown

Unknown

Unknown

O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (NM) O157:H7 (rough) O157:H7 (non-STX producing) O157:H7 (non-STX producing) O157:H7 (non-STX producing) O157:H7 (non-STX producing)

ATCC 700376 ATCC 700377 ATCC 700378

Clinical isolate Clinical isolate Clinical isolate

PSU DR3

Beef Beef Meat Meat Meat Meat Meat

Es 351

USDA-ARS 55AC1 f USDA-ARS 131AC1 USDA-ARS 237AC1 USDA-ARS 299AB3

FDAMA6

ATCC 43888

Clinical isolate

+

47

Escherichia coli

48

ATCC 700728

Unknown

+

Escherichia coli

49

ES 340

Unknown

+

Escherichia coli

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50

USDA-ARS 114AC1

Meat

+

Escherichia coli